馬克思主義學院的前身，可追溯至1958年的廣州師範學院馬克思列甯主義教研室，1988年，原馬克思列甯主義教研室成立政治經濟管理系，正式招收思想政治教育專業本科生，并負責全院政治理論公共課教學。

2000年，由廣州師範學院、華南建設院（西院）、廣州教育學院（廣州師專）、原廣州大學四所院校為主體合并組成廣州大學，原廣州師範學院政治經濟管理系與德育教研室、原華南建設學院（西院）社會科學部、原廣州教育學院政治系、原廣州大學社會科學部共同組成法學院，招收思想政治教育、法學和行政管理專業本科生，并負責全校的“兩課”的教學；2000年，由教育學院牽頭，法學院正式招收學科教學法（思想政治教育專業）碩士研究生；2002年，取得思想政治教育碩士點并正式招生。

2004年，法學院根據學科專業發展需要一分為三，分别組成公共管理學院、法學院和社會科學部。思想政治教育系隸屬于公共管理學院。2005年，取得馬克思主義哲學、馬克思主義基本原理、馬克思主義發展史碩士點。2009年開始招生全日制教育碩士研究生。2010年獲得馬克思主義理論一級學科碩士點。

2012年，公共管理學院政治教育系與社會科學部合并組建馬克思主義學院（政治與公民教育學院），7月5日召開成立大會并宣布學院黨政班子。同年，馬克思主義理論一級學科入選廣東省一級優勢重點學科。2017年後停止使用政治與公民教育學院名稱，隻使用馬克思主義學院名稱。2020年思想政治教育專業入選國家一流本科專業，2022年在教育學一級學科博士點下設“馬克思主義教育思想研究”二級學科博士點招生方向，并正式招收首屆學術博士生。

第一屆黨政班子成員（2012.07-2017.01）

院長：趙中源

黨委書記：劉樹謙

副院長：羅明星、夏宏、黃禧祯（2015年任職）

黨委副書記：李燕冰

第二屆黨政班子成員（2017.02-2020.12）

院長：趙中源

黨委書記：羅明星

副院長：黃禧祯、冉傑、吳陽松（2019年任職）

黨委副書記：朱曉軍

第三屆黨政班子成員（2021.01-）

院長：趙中源

黨委書記：羅明星

副院長：冉傑、吳陽松、左康華

黨委副書記：梅淑甯